key: cord-0913156-9so3orib
authors: Klussmeier, Anja; Behrens, Geoffrey A.; Lange, Vinzenz
title: Etablierung der PCR-basierten SARS-CoV-2-Testung im Hochdurchsatz
date: 2020-09-05
journal: BIOspektrum (Heidelb.)
DOI: 10.1007/s12268-020-1431-1
sha: 9b5803acdaabc27f5e26f30cd74e2e7286897696
doc_id: 913156
cord_uid: 9so3orib

Timely identification and isolation of affected individuals is one of the most important factors to control spreading of the newly emerged SARS-CoV-2. Consequently, it is crucial to maintain sufficient sample capacities in diagnostic laboratories. Here, we present a high-through-put approach for PCR-based SARS-CoV-2 testing. The implementation of sample pooling reduces costs and workload, especially in times with low population prevalence.

ó Im Dezember 2019 wurde das neuartige Coronavirus SARS-CoV-2, Auslöser der Erkrankung Covid-19, im chinesischen Wuhan erstmalig beschrieben [1] . Seitdem stellt es die staatlichen Gesundheitssysteme weltweit vor große Herausforderungen. Nach ersten lokal begrenzten Geschehen im Januar 2020 erreichte die Anzahl diagnostizierter SARS-CoV-2-Infektionen in Deutschland Mitte März 2020 einen Höhepunkt.

Eine entscheidende Maßnahme zur Eindämmung des SARS-CoV-2-Infektionsgeschehens ist die rechtzeitige Diagnose von Einzelfällen. Auf diese Weise können mögliche Kontaktpersonen identifi ziert, Quarantänemaßnahmen verhängt und Infektionsketten unterbrochen werden. Ende März 2020 war daher abzusehen, dass bei einem stark steigendem Infektionsgeschehen, wie es zu diesem Zeitpunkt in Italien oder Spanien beobachtet werden konnte, hohe Laborkapazitäten für die Diagnostik von SARS-CoV-2 in Deutschland benötigt werden würden.

Das DKMS Life Science Lab ist das weltweit größte Labor für die HLA-Genotypisierung von Personen, die sich für eine Stammzellspende registrieren möchten. Pro Werktag werden hier rund 5.000 Proben im Hochdurchsatz bearbeitet: von der Annahme der Abstrichtupfer, über die DNA-Isolation, PCR und Sequenzierung bis hin zur Datenanalyse [2, 3] 

Der hier beschriebene Laborprozess zur Diag nostik von akuten SARS-CoV-2-Infektionen wurde in einem Zeitraum von etwa drei Monaten geplant, umgesetzt und validiert. Ein großer Teil dieser Zeit wurde in eine benutzerfreundliche und weitestgehend automatische Funktionalität der Probensteuerung, -überwachung und -befundung investiert. Dies ermöglicht insbesondere die initiale Vereinigung von Proben mit einer automatisch ausgelösten Einzelanalyse positiver Pools. Bei Anpassung unserer betrieblichen Abläufe (Drei-Schicht-Betrieb, keine parallele Bearbeitung von HLA-Spenderproben) könnte damit eine maximale Kapazität von bis AUTOREN

Studium der Humanbiologie an der Universität Marburg

Postdoktorand an der Rijksuniversiteit Groningen, Niederlande. 2016-2019 Spezialist für Labortechnik und Automation und seit 2019 Business Development Manager bei DKMS Life Science Lab GmbH in Dresden. Vinzenz Lange 1994-2000 Studium der Biochemie an der Universität Regensburg

Abteilungsleiter Labortechnik und seit 2016 Geschäftsführer (CTO) der DKMS Life Science Lab GmbH in Dresden