key: cord-0793968-cwtuvrij authors: Braun, Volkmar; Brötz-Oesterhelt, Heike; Mueller, Jonathan Wolf; Aichane, Khadija; Lassak, Jürgen; Mais, Nils; Bange, Gert; Kruck, Daniela; Sander, Johannes; Shvarev, Dmitry; Schipper, Kerstin; McIntosh, Matthew; Kretz, Jonas title: Journal Club date: 2020-10-14 journal: Biospektrum (Heidelb) DOI: 10.1007/s12268-020-1461-8 sha: 5e844892a1a246043ee6db6796cd3acb6a3d9f3f doc_id: 793968 cord_uid: cwtuvrij nan ó Vitamin B 12 (B 12 ) bindet an das BtuB-Rezeptorprotein, das eine Fass-artige Struktur (β-barrel) einnimmt, die innen einen Kanal bildet, der durch eine globuläre Domäne verschlossen ist. Um die Translokation von B 12 durch BtuB zu bestimmen, bauten sie BtuB in eine asymmetrische heterogene Lipiddoppelschichtmembran ein, die die OM simulieren soll. B 12 bindet zunächst an die zehn extrazellulären Schleifen. In den SMD-Experimenten folgt B 12 nicht der globulären Domäne in Richtung Periplasma, sondern wird von den extrazellulären Schleifen festgehalten. Erst beim Anlegen einer Kraft von 20 kcal/mol/Å wird B 12 freigesetzt, wobei die globuläre Domäne sich um 175 Å dehnt. Während der ersten 0-24 Å Domänenbewegung rotiert B 12 um die BtuB-Hauptachse, sodass der Corrinring parallel zur Achse orientiert ist. Die Messung der Schleifenbewegungen unterscheidet fünf Strukturvarianten: ohne gebundenes B 12 / Domäne gefaltet, gebundenes B 12 / Domäne gefaltet, gebundenes B 12 / Domäne entfaltet, partiell transportiertes B 12 / Domäne entfaltet, völlig transportiertes B 12 / Domäne entfaltet. BtuB ohne Beladung mit B 12 steht im Gleichgewicht zwischen offener und geschlossener Form. Zu Beginn des Transports sind die Konformationen der Schleifen auf die Bindung von B 12 optimiert. Während der Bewegung der Domäne wird die offene Schleifenform bevorzugt, die sich über der B 12 -Bindestelle schließt. Die partielle Entfaltung der Domäne dient dazu, während des Transports die Schließung der Schleifen zu initiieren. Dies zeigt eine hohe Strukturdynamik des BtuB-Transporters Energie-getriebener Transport durch die äußere Membran von Escherichia coli mit massiven Änderungen während des Transports. Y Die Arbeit untersucht die Strukturänderungen, die Spemannstraße 35, D-72076 Tübingen, volkmar.braun@tuebingen.mpg.de Prof. Dr. Heike Brötz-Oesterhelt, Interfakultäres Institut für Mikrobiologie und Infektionsmedizin Diabetes and Metabolism (CEDAM), IBR Tower Institut für Neurophysiologie, Carl-Neuberg-Straße 1, D-30625 Hannover, kruck.daniela@mh-hannover.de Dmitry Shvarev